ПЦР-лаборатория тратит на пробоподготовку больше времени, чем на саму амплификацию. Это факт, известный каждому, кто проработал в диагностике хотя бы год. Термоциклер делает своё дело за полтора часа. А вот нарезать ткань, взвесить, внести в лизирующий буфер, проинкубировать с протеиназой, отмыть, высушить колонку, элюировать - это часы. И если на выходе вы получаете элюат с примесью фенолов, полисахаридов или гема, ПЦР встаёт. Кривая амплификации ползёт вправо или не появляется вовсе. Вы перезакладываете анализ, пишете объяснительную, теряете день. Себестоимость плохого выделения - это не цена набора. Это цена потерянного времени, испорченных реактивов и необходимости заново отбирать образец, если он был единичным.

Поэтому раздел собран не по принципу «давайте положим всё, что есть». Здесь только те наборы, которые мы проверили на реальных образцах в условиях, приближенных к рутине. Не на синтетических матрицах, не на идеально чистых культурах клеток, а на том, что приходит в лабораторию в час дня, когда курьер уже уехал, а результат нужен к вечеру.

Что именно лежит в разделе
Наборы для выделения ДНК из крови. D-Blood на колонках и MagBlood на магнитных частицах. Первый - для лабораторий с потоком до двадцати образцов в день. Второй - для автоматизации на магнитных станциях. Оба работают с цельной кровью, плазмой, сывороткой, ликвором, лейкоцитарной плёнкой. Оба дают чистую ДНК без примеси гема, который ингибирует Taq не хуже растительных полисахаридов. MagBlood дополнительно поддерживает все стандартные антикоагулянты: K3EDTA, цитрат натрия в двух концентрациях, CPDA, гепарин. Это важно для лабораторий, которые получают кровь из разных источников и не всегда знают, в какую пробирку её взяли.

Наборы для выделения ДНК из тканей. D-Tissues на колонках. Лизис с протеиназой K, сорбция на мембране из диоксида кремния. Работает с почками, печенью, мышцами, селезёнкой и любыми другими органами. Протокол рассчитан на то, чтобы разбить плотную соединительную ткань и не оставить кусков, которые забьют колонку. Для лабораторий, которые работают с биопсийным материалом, ветеринарных центров, научных групп на животных моделях.
Наборы для выделения ДНК из клеточных культур. D-Cells. Бактерии, дрожжи, культуры клеток млекопитающих. Отдельный протокол для грамположительных бактерий, потому что у них клеточная стенка толще и просто лизирующим буфером её не взять. Лизоцим в комплекте не идёт, но протокол подразумевает его добавление на стадии лизиса для тех, кто работает с грамположительными штаммами.

Наборы для выделения РНК. RUplus на колонках и R-Blood для крови и клеточных культур. RUplus - рабочая лошадка для эукариотических клеток, бактерий, вирусов, мазков и соскобов. Выдаёт до 50 мкг тотальной РНК, сохраняет целостность, подходит для последующей ОТ-ПЦР. R-Blood решает проблему выделения РНК из цельной крови через двухколоночную схему: на первой оседает ДНК, на второй РНК. Обработка ДНКазой не нужна, потому что ДНК уже убрана. При желании можно снять ДНК с первой колонки и использовать её для параллельного анализа.

D-Swabs для мазков и соскобов. Буккальный эпителий, слюна, мазки со слизистых, смывы с поверхностей. Для лабораторий, которые работают с неинвазивным забором: генетическое тестирование, судебная экспертиза, контроль санитарного состояния на производстве.
Наборы для выделения из растений и почвы. D-Plants, R-Plants, MagPlants и D-Soils. Это те же позиции, что лежат в разделе «Выделение ДНК и РНК из растений», но здесь они собраны вместе с остальными наборами, чтобы лаборатория, которая работает с разными матрицами, закрывала все потребности в одном разделе.

Реагент «Лира Кариб» для фенол-хлороформной экстракции. Отечественная замена тризолу. Окрашен, чтобы видеть фазы при разделении. Выделяет РНК, ДНК и белки из одного образца. Для тех, кто до сих пор работает классическим методом и не хочет менять протокол, но хочет заменить ушедший импортный реагент на стабильный отечественный аналог.

На чём не стоит экономить
Элюирующий объём. Многие наборы позволяют варьировать объём элюции, и это не просто цифра в протоколе. Если вы элюируете в 200 мкл, концентрация ДНК будет низкой, и слабоположительные образцы могут выпасть из детекции. Если в 30 мкл - концентрация высокая, но часть ДНК останется на мембране. Оптимальный объём для большинства задач 50-100 мкл. Наши наборы это предусматривают.

Качество воды для элюции. Не элюируйте ДНК водой из дистиллятора, который чистят раз в год. Берите воду для ПЦР из проверенного источника. Или ту, что идёт в комплекте с набором, если она там есть. Сэкономите на воде - заплатите временем за перепостановку.
Протеиназа K. Если протокол требует протеиназу, не пропускайте этот этап. Не думайте, что лизирующий буфер справится сам. Ткани животных, особенно печень и почки, содержат столько белка, что без протеиназной обработки вы получите вязкий лизат, который не пройдёт через колонку.

Кому
Клинико-диагностическим лабораториям, ветеринарным центрам, фитосанитарным станциям, научным группам, криминалистическим лабораториям, фармацевтическим производствам, биотехнологическим стартапам. Всем, кто работает с нуклеиновыми кислотами и понимает, что 80 процентов проблем с ПЦР решаются не сменой термоциклера, а сменой подхода к пробоподготовке. Если вы до сих пор считаете, что выделение - это просто добавление буфера и центрифугирование, откройте любую методичку по работе с почвой или хвоёй. Жизнь быстро научит. А наши наборы сделают так, что урок не будет стоить потерянных образцов.